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# VIPR, el ancestro de CRISPR que se escondía en los virus: rodea el ADN y no lo corta
- URL: https://fomoera.com/vipr-ancestro-crispr-virus/
- Published: 2026-09-22T15:00:33.000Z
- Updated: 2026-09-22T15:00:33.000Z
- Description: Investigadores del laboratorio de Jennifer Doudna en el IGI de UC Berkeley describieron VIPR, un sistema hallado en virus que sería el antepasado de CRISPR: reconoce el ADN con un código con saltos, se enrosca en la doble hélice y apunta a una nueva vía de edición genética.
- Author: Gerardo Pavez
- Tags: Tecnología y Ciencia, Biotecnología

Investigadores del laboratorio de Jennifer Doudna, en el Innovative Genomics Institute (IGI) de la Universidad de California en Berkeley, describieron VIPR, un sistema hallado en virus que sería el antepasado de CRISPR y que había pasado inadvertido porque reconoce el ADN con un código nunca antes visto. En dos estudios conectados, publicados el 17 de septiembre de 2026 en la revista Science, el equipo muestra que VIPR (Viral Interference Programmable Repeat) es más antiguo que CRISPR, se enrosca alrededor de la doble hélice del ADN como una serpiente en lugar de cortarla y puede reprogramarse para silenciar genes. El hallazgo reescribe el origen de CRISPR, ya que las bacterias habrían tomado un arma creada por virus para atacar a otros virus, y apunta a una posible nueva herramienta de edición genética, aunque por ahora solo se ha demostrado en el laboratorio.

## Qué es VIPR y por qué es más antiguo que CRISPR

En la naturaleza, CRISPR es el sistema inmunitario que bacterias y arqueas usan para defenderse de los virus: guardan fragmentos de ADN viral y emplean copias de ARN que funcionan como fichas policiales para reconocer al invasor. VIPR apareció en un lugar distinto, dentro de los propios virus. Según el equipo del IGI, es más antiguo que CRISPR y corresponde a un progenitor que había quedado oculto porque no sigue las reglas conocidas del código genético.

Los sistemas CRISPR se dividen en dos clases. Los de Clase 2, como el conocido CRISPR-Cas9, son los más recientes y se apoyan en una sola proteína grande, lo que los convirtió en el centro de la edición genética. Peter Yoon y Kenneth Loi, del laboratorio de Doudna, indagaban en cambio el origen de los sistemas de Clase 1, más comunes en la naturaleza pero menos estudiados y bastante más antiguos: se cree que **LUCA**, el último ancestro común de toda la vida celular, ya tenía uno.

Para rastrear algo tan remoto, el grupo recurrió a una búsqueda asistida por inteligencia artificial que compara la forma de las proteínas en vez de su secuencia. "Si quieres encontrar algo verdaderamente antiguo, tienes que buscar algo con una forma particular, no con una secuencia particular", explicó Doudna. Al revisar unos 2.3 millones de estructuras surgieron unos cientos de candidatos, y uno tenía la forma de una proteína CRISPR pese a que nunca aparecía junto a un ARN de CRISPR. Estaba emparejado con un ARN que no coincidía con nada conocido.

![Close-up of wooden Scrabble tiles spelling 'Genes Will Out' on a white background.](https://fomoera.com/content/images/2026/09/fomoera-close-up-of-wooden-scrabble-tiles-spelling-genes-will-out-on-a-white-background-pexels-8118274.webp)

El ARN de VIPR lee el ADN saltándose una de cada tres bases. Imagen ilustrativa. · Foto de [Brett Jordan](https://www.pexels.com/@brettjordan?ref=fomoera.com) en [Pexels](https://www.pexels.com/photo/brown-wooden-scrabble-tiles-on-white-surface-8118274/?ref=fomoera.com)

## Un código genético con saltos que ignora las mutaciones

El ARN de VIPR mantuvo al equipo estancado durante meses. A diferencia del ARN de CRISPR, que contiene una copia exacta de un tramo del ADN del virus, este no encajaba con ninguna secuencia. La pista llegó con un modelo de lenguaje genómico, una IA entrenada para predecir qué base sigue a otra en una cadena de ADN, igual que un modelo de texto predice la palabra siguiente en una frase.

El modelo detectó un patrón repetido que nadie había visto a simple vista: tres bases que casi siempre eran GGT, seguidas de dos bases muy variables. VIPR no lee el ADN de corrido, sino que salta: empareja dos bases e ignora la tercera, una y otra vez. Esa tercera base descartada ocupa la llamada **posición oscilante** del código genético (la tercera de cada codón), el punto donde una mutación suele no cambiar la proteína resultante y, por eso, donde el virus muta con más facilidad.

Al pasar por alto justo las posiciones que más cambian, VIPR sigue reconociendo a su objetivo aunque el virus mute. Yoon lo resumió así:

> Es un mecanismo que enmascara deliberadamente las partes del código que tienen más probabilidad de cambiar. Es un algoritmo para eliminar ruido. Le pone muy difícil al virus atacado escapar del peligro.

Ningún sistema conocido hacía algo parecido, subrayó, y el patrón solo se volvió visible al combinar la intuición del equipo con los modelos de IA.

## Se enrosca en el ADN en lugar de cortarlo

Con el código descifrado, el equipo reconstruyó cómo actúa VIPR y encontró señales de una vieja guerra entre virus. Los virus que llevan estos sistemas atacan a otros virus emparentados, a menudo los que infectan al mismo huésped. Una vez que supieron qué buscar, los hallaron por todas partes: en muestras ambientales de suelos y otros entornos aparecieron cientos de miles, e incluso en bacteriófagos que el propio laboratorio tenía guardados en el congelador.

El mecanismo también rompe lo esperado. CRISPR-Cas9 separa las dos hebras del ADN para llegar a su blanco y cortarlo. VIPR toma otro camino, el que le da nombre: se enrosca alrededor de la doble hélice como una serpiente. Según Terry Zhang, del mismo laboratorio, el filamento de VIPR desestabiliza el ADN hasta que una de sus hebras se suelta para aparearse con el ARN guía y forma una estructura de triple cadena. En lugar de cortar el gen, lo envuelve y lo apaga. El equipo mostró que se puede reprogramar VIPR para silenciar un gen uniéndose a la región que controla su encendido.

## Por qué podría sumar a la edición genética

CRISPR ya se usa para silenciar genes, pero VIPR trae ventajas propias como posible herramienta. Es el sistema guiado por ARN más pequeño que se ha encontrado, lo que facilita introducirlo en las células, un cuello de botella habitual con las voluminosas enzimas de CRISPR. Tampoco tiene restricciones sobre dónde actuar: CRISPR-Cas9 necesita una secuencia corta llamada **PAM** cerca del punto que corta, mientras que VIPR puede dirigirse a cualquier parte del genoma.

"No hay ningún sistema que envuelva el ADN de esta manera. Sospechamos que esta geometría inusual debería permitir aplicaciones que antes no se podían hacer", dijo Yoon, primer autor del trabajo.

El estudio también cierra el círculo evolutivo. En algunos casos, sistemas VIPR completos pasaron de los virus a las bacterias: el huésped se quedó con el arma de sus atacantes y la volvió contra ellos, y de ese salto habrían surgido los sistemas CRISPR de Clase 1 en algún momento anterior a LUCA. Aun así, VIPR sigue en fase de laboratorio: se probó el silenciamiento de genes y la defensa contra virus, no terapias en personas.

Por ahora, VIPR aporta un mecanismo distinto al repertorio de la edición genética y una hipótesis nueva sobre cómo empezó la inmunidad de la vida en la Tierra. "Este trabajo es un gran recordatorio de lo compleja que es la biología y de lo poco que aún sabemos", dijo Doudna. "Todavía hay conceptos fundamentales por descubrir."

*Fuentes:* [1](https://innovativegenomics.org/news/vipr-systems-origins-of-crispr/?ref=fomoera.com), [2](https://ls.berkeley.edu/news/igi-and-mcb-researchers-find-evolutionary-ancestor-crispr-viruses?ref=fomoera.com)